L'Indice di anti-corruzione dei sistemi governativi di difesa ha valutato la Croazia a livelli medi. Secondo un rapporto di Transparency International, molti membri della NATO non hanno meccanismi di controllo per la trasparenza nel settore della difesa. "Nonostante il Ministro Croato della Difesa abbia ridotto il numero di "contratti segreti", occorre fare ancora molto. Inoltre, preoccupa la mancanza di trasparenza nell'operato dei servizi di sicurezza," ha dichiarato Gordan Bosanac, ricercatore del Centre for Peace Studies, secondo il quale anche il controllo civile deve essere rafforzato.